کارشناسان خاطرنشان می کنند که اگر رطوبت ساز به طور نادرست استفاده شود، نه تنها هوا را تصفیه نمی کند، بلکه ممکن است خطر ابتلا به بیماری های تنفسی را افزایش دهد. هنگام استفاده از مرطوب کننده، تمیز کردن مرتب آن ضروری است. در غیر این صورت، میکروارگانیسم ها می توانند از طریق مه به هوا منتقل شوند و متعاقباً وارد دستگاه تنفسی انسان شوند و فرد را مستعد ابتلا به "پنومونی مرطوب کننده" می کند. علاوه بر این، رطوبت بیشتر هوا لزوما بهتر نیست. در زمستان، سطح رطوبتی که بدن انسان در آن احساس راحتی می کند حدود 50 درصد است. اگر رطوبت خیلی زیاد شود، افراد ممکن است دچار سفتی قفسه سینه و مشکل در تنفس شوند. بنابراین، مرطوب سازی باید در حد اعتدال انجام شود.
در زیر سه اقدام احتیاطی کلیدی وجود دارد که باید رعایت شود:
1. اگر خود رطوبت ساز غیربهداشتی باشد، عوامل بیماری زا می توانند توسط بخار آب به هوا منتقل شوند و سلامت انسان را به خطر بیندازند.
2. آب معمولی شیر را مستقیماً داخل دستگاه مرطوب کننده نریزید. آب لوله کشی حاوی مواد معدنی مختلفی است که می تواند به اواپراتور رطوبت ساز آسیب برساند و رسوبات معدنی (آهک) نیز می تواند عمر مفید دستگاه را کاهش دهد. علاوه بر این، اتم های کلر و میکروارگانیسم های موجود در آب لوله کشی ممکن است همراه با مه در هوا پراکنده شوند و باعث آلودگی هوا شوند. اگر آب لوله کشی دارای محتوای معدنی بالایی باشد (یعنی "سخت" است)، مه ساطع شده توسط مرطوب کننده-که حاوی یون های کلسیم و منیزیم است-ممکن است پودر سفید رنگی تولید کند که هوای داخل خانه را بیشتر آلوده می کند.
3. استفاده نادرست می تواند باعث ایجاد شرایط آلرژیک شود: به طور خاص، "تب مرطوب کننده".

